El Laboratorio Ecotono de la Universidad Nacional del Comahue contribuye desde 1989 a la generación de conocimiento científico en el vasto campo de la Ecología, en todas sus escalas e interfaces con disciplinas tan diversas como Comportamiento Animal, Antropología, Sistemática, Evolución, Biogeografía, Paleoecología, Genética, y Fisiología Vegetal.
Desde un punto de vista teórico, se busca comprender fenómenos naturales mediante el análisis de patrones y procesos que se manifiestan a diversas escalas temporales y geográficas (continentales, regionales, locales y de micrositio), así como determinar los mecanismos que controlan la estructura y el funcionamiento de los sistemas biológicos. Desde un punto de vista aplicado, se busca aportar información útil para la conservación de la diversidad biológica en sus múltiples manifestaciones, y contribuir a una mejor comprensión de las relaciones pasadas y actuales entre el hombre y la naturaleza.